| 郡 | 神社名 | 御祭神 | 社格 | 備考 |
| 意宇郡 | 熊野坐神社 | 大社 | 名神大社 | |
| 意宇郡 | 前神社 | 小社 | 稲田神社に合祀 | |
| 意宇郡 | 能利刀神社 | 小社 | 伊邪那美神社に合祀 | |
| 意宇郡 | 田中神社 | 小社 | 伊邪那美神社に合祀 | |
| 意宇郡 | 楯井神社 | 小社 | 伊邪那美神社に合祀 | |
| 意宇郡 | 速玉神社 | 小社 | 伊邪那美神社に合祀 | |
| 意宇郡 | 布吾弥神社 | 小社 | 伊邪那美神社に合祀 | |
| 意宇郡 | 磐坂神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 佐久佐神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 真名井神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 鷹日神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 山代神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 売豆紀神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 野白神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 布自奈大穴持神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 布自奈神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 久多弥神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 玉作湯神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 同社坐韓国伊太神社 | 小社 | 玉作湯神社に合祀 | |
| 意宇郡 | 売布神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 来待神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 佐為神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 佐為高守神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 完道神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 宇留布神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 須多神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 揖夜神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 同社坐韓国伊大神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 筑陽神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 同社坐波夜都武自和気神社 | 小社 | 筑陽神社に合祀 | |
| 意宇郡 | 山狭神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 同社坐久志美気濃神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 布弁神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 都弁志呂神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 野城神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 同社坐大穴持神社 | 小社 | 野城神社に合祀 | |
| 意宇郡 | 同社坐大穴持御子神社 | 小社 | 野城神社に合祀 | |
| 意宇郡 | 佐久多神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 同社坐韓国伊大神社 | 小社 | 佐久多神社に合祀 | |
| 意宇郡 | 志保美神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 意多伎神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 同社坐御訳神社 | 小社 | 意多伎神社に合祀 | |
| 意宇郡 | 市原神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 由貴神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 勝日神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 勝日高守神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 田面神社 | 小社 | ||
| 意宇郡 | 久米神社 | 小社 | ||
| 嶋根郡 | 布自伎美神社 | 小社 | ||
| 嶋根郡 | 多気神社 | 小社 | ||
| 嶋根郡 | 久良弥神社 | 小社 | 久良弥神社に合祀 | |
| 嶋根郡 | 同社坐波夜都武自別神社 | 小社 | ||
| 嶋根郡 | 河上神社 | 小社 | ||
| 嶋根郡 | 長見神社 | 小社 | ||
| 嶋根郡 | 門江神社 | 小社 | 布自伎美神社に合祀 | |
| 嶋根郡 | 横田神社 | 小社 | ||
| 嶋根郡 | 加賀神社 | 小社 | ||
| 嶋根郡 | 尓佐神社 | 小社 | ||
| 嶋根郡 | 尓佐能加志能為神社 | 小社 | ||
| 嶋根郡 | 法吉神社 | 小社 | ||
| 嶋根郡 | 生馬神社 | 小社 | ||
| 嶋根郡 | 美保神社 | 小社 | ||
| 秋鹿郡 | 佐陁神社 | 小社 | ||
| 秋鹿郡 | 宇多紀神社 | 小社 | 佐陁神社に合祀 | |
| 秋鹿郡 | 大井神社 | 小社 | ||
| 秋鹿郡 | 日田神社 | 小社 | ||
| 秋鹿郡 | 御井神社 | 小社 | ||
| 秋鹿郡 | 内神社 | 小社 | ||
| 秋鹿郡 | 垂水神社 | 小社 | ||
| 秋鹿郡 | 恵曇神社 | 小社 | ||
| 秋鹿郡 | 許曽志神社 | 小社 | ||
| 秋鹿郡 | 大野津神社 | 小社 | ||
| 楯縫郡 | 玖潭神社 | 小社 | ||
| 楯縫郡 | 佐香神社 | 小社 | ||
| 楯縫郡 | 宇美神社 | 小社 | ||
| 楯縫郡 | 多久神社 | 小社 | ||
| 楯縫郡 | 御津神社 | 小社 | ||
| 楯縫郡 | 能呂志神社 | 小社 | ||
| 楯縫郡 | 許豆神社 | 小社 | ||
| 楯縫郡 | 許豆神社 | 小社 | ||
| 楯縫郡 | 水神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 大穴持神社 | 小社 | 所在地不明 | |
| 出雲郡 | 杵築大社 | 大社 | 名神大社 | |
| 出雲郡 | 同社大神大后神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社坐伊能知比売神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社神魂御子神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社神魂伊能知奴志神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社神大穴持御子神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社大穴持伊那西波伎神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社大穴持御子玉江神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 阿須伎神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社神韓國伊大弖神社 | 小社 | 阿須伎神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 同社天若日子神社 | 小社 | 阿須伎神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 同社須佐袁神社 | 小社 | 阿須伎神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 同社神魂意保刀自神社 | 小社 | 阿須伎神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 同社神阿須伎神社 | 小社 | 阿須伎神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 同社神伊佐那伎神社 | 小社 | 阿須伎神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 同社神阿麻能比奈等理神社 | 小社 | 阿須伎神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 同社神伊佐我神社 | 小社 | 阿須伎神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 同社阿遅須伎神社 | 小社 | 阿須伎神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 同社天若日子神社 | 小社 | 阿須伎神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 御碕神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 因佐神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 久佐加神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社大穴持海代日古神社 | 小社 | 来阪神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 同社大穴持海代日女神社 | 小社 | 来阪神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 伊努神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社神魂伊豆乃売神社 | 小社 | 伊努神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 同社神魂神社 | 小社 | 伊努神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 同社比古佐和気神社 | 小社 | 伊努神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 意布伎神社 | 小社 | 伊努神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 都我利神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 伊佐波神社 | 小社 | 都我利神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 美談神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社比売遅神社 | 小社 | 美談神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 県神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社和加布都努志神社 | 小社 | 県神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 印波神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 都武自神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 宇加神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 美努麻神社 | 小社 | 奥宇賀神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 布勢神社 | 小社 | 奥宇賀神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 意保美神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 出雲神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社韓國伊大弖神社 | 小社 | 諏訪神社に合祀 | |
| 出雲郡 | 斐代神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 韓竈神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 鳥屋神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 神代神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 曽枳能夜神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 同社韓国伊大神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 伊佐賀神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 久武神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 加毛利神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 御井神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 伊甚神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 波知神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 立虫神社 | 小社 | ||
| 出雲郡 | 阿吾神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 弥久賀神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 阿祢神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 佐志武神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 多伎藝神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 多伎神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 同社大穴持神社 | 小社 | 多伎神社に合祀 | |
| 神門郡 | 国村神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 那売佐神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 同社坐和加須西利比売神社 | 小社 | 那売佐神社に合祀 | |
| 神門郡 | 佐伯神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 智伊神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 比布智神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 同社坐神魂子角魂神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 朝山神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 阿利神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 同社坐加利比売神社 | 小社 | 阿利神社に合祀 | |
| 神門郡 | 八野神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 大山神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 久奈為神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 塩冶神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 富能加神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 塩冶比古神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 塩冶比古麻由弥能神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 比那神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 阿須利神社 | 小社 | ||
| 神門郡 | 神産魂命子午日命神社 | 小社 | 塩冶神社に合祀 | |
| 神門郡 | 塩冶日子命御子焼大刀天穂日子命神社 | 小社 | 塩冶神社に合祀 | |
| 飯石郡 | 三屋神社 | 小社 | ||
| 飯石郡 | 多倍神社 | 小社 | ||
| 飯石郡 | 飯石神社 | 小社 | ||
| 飯石郡 | 須佐神社 | 小社 | ||
| 飯石郡 | 川辺神社 | 小社 | ||
| 仁多郡 | 伊我多気神社 | 小社 | ||
| 仁多郡 | 三沢神社 | 小社 | ||
| 大原郡 | 宇能遅神社 | 小社 | ||
| 大原郡 | 同社坐須美祢神社 | 小社 | ||
| 大原郡 | 神原神社 | 小社 | ||
| 大原郡 | 八口神社 | 小社 | ||
| 大原郡 | 御代神社 | 小社 | ||
| 大原郡 | 布須神社 | 小社 | ||
| 大原郡 | 斐伊神社 | 小社 | ||
| 大原郡 | 同社坐斐伊波夜比古神社 | 小社 | 斐伊神社に合祀 | |
| 大原郡 | 来次神社 | 小社 | ||
| 大原郡 | 加多神社 | 小社 | ||
| 大原郡 | 佐世神社 | 小社 | ||
| 大原郡 | 西利太神社 | 小社 | ||
| 大原郡 | 海潮神社 | 小社 | ||
| 能義郡 | 天穂日命神社 | 小社 |
